SNAREタンパク質ファミリーの主要メンバーとして、YKT6は内質網からゴルジ体、細胞膜、分泌経路に至るまで、さまざまな膜輸送プロセスを調節する役割を果たします。その機能は、様々なSNAREパートナー蛋白質との結合能力の柔軟性に依存しています。
ゴルジ体複合体内のレトログレードの小胞輸送プロセスにおいて、YKT6は重要な役割を果たします。ゴルジ体複合体の正常な機能と糖鎖修飾は、小胞の正確な結合と融合に依存しています。クラシカルな小胞結合複合体COGや主要なv-SNAREタンパク質(GS28、GS15など)が欠損すると、細胞は適応的な補償メカニズムを活性化します。研究では、YKT6がSyntaxin5 (STX5)、VTI1B、STX8と非クラシカルなSNARE複合体(STX5/VTI1B/STX8/YKT6)を形成することが示されています。この複合体は野生型細胞でも存在しますが、GS28またはCOGが欠損した細胞ではその使用頻度が著しく上昇し、クラシカルな経路の欠失を部分的に補償し、ゴルジ体複合体の糖鎖修飾機能を維持し、膜輸送組織における著しい補償可塑性を示しています[17]。また、果蝇の光受容体における極性輸送の研究では、YKT6がnSybや他のSNAREタンパク質と協力して、ロドプシンなどのタンパク質を特殊化した膜構造であるラボドメールへ輸送することに非常に重要であり、特定の細胞タイプでの極性輸送においてYKT6が重要な役割を果たしていることが示されています[18]。
YKT6の分泌経路における目立った機能の1つは、エクソソームの生合成と放出を調節することです。エクソソームは細胞間通信の重要な媒体であり、特に腫瘍の転移プロセスで重要な役割を果たします。大腸がんでは、転移に関連するタンパク質MACC1がYKT6のプロモーター領域に結合し、その転写を活性化することが証明されており、これによりYKT6が細胞質に蓄積します。YKT6は多小胞体と細胞膜の融合を促進する主要なSNAREタンパク質であり、YKT6の発現増加は直接エクソソームの分泌量を著しく増加させ(約2.9倍)、さらに重要なことに、MACC1-YKT6シグナル軸は、エクソソーム内へのオンコプロテインc-Metの選択的なパッケージングを促進し、c-Metが豊富なエクソソームが受容細胞に取り込まれると、上皮-間葉転換(EMT)を誘導し、細胞の運動性と侵襲性を高め、転移を促進する正のフィードバックループを形成します[10]。対照的に、神経系疾患モデルでは、α-シヌクレインの異常蓄積がYKT6の脂質修飾(ファルネシル化)を破壊し、膜結合形のYKT6を減少させることで、エクソソームの分泌を阻害し、α-シヌクレインが細胞内に蓄積し、悪循環を形成することが確認されています[13]。これらは2つの側面から、YKT6がエクソソーム分泌経路の中心的なスイッチとして機能することを確認しています。
YKT6は特化した分泌プロセスの調節にも関与しています。膵β細胞では、インスリンの分泌は精密に制御された一連のエキソサイトーシスイベントに依存しています。研究では、YKT6のゲラニルゲラニル化を担うGGTase-III(そのαサブユニットはPTAR1)が膵β細胞で発現しており、PTAR1の欠損はグルコースやカリウムイオンによって刺激されるインスリン分泌を著しく弱めることが示されています。YKT6はGGTase-IIIの既知の基質タンパク質であるため、これはGGTase-IIIがYKT6の修飾を通じてインスリン分泌小胞の輸送や融合を制御し、インスリンの放出に影響を与えている可能性を示唆しています[9]。生殖系の研究では、YKT6はマウスの精子形成に非常に重要です。生殖細胞におけるミオーシス期での条件的なYkt6欠損は、男性の完全な不妊症を引き起こし、ミオーシスの進行が阻害されます。研究では、YKT6を失った精母細胞は、ゴルジ体複合体の形態が異常となり、リソソームの数が減少し、小胞輸送に関連するタンパク質の発現が不規則になり、細胞間橋の構造が不安定になることが示されています。これは、YKT6が小胞輸送を調節してミオーシスプロセスを促進し、男性の生殖能力を保証していることを示しています[8]。
以上のように、YKT6は形状の柔軟性と様々なSNAREパートナー蛋白質との多重役割の組み合わせにより、細胞内の膜輸送と分泌経路の多機能ハブとなっています。ゴルジ体複合体の基本機能や極性輸送の維持だけでなく、エクソソームの分泌、ホルモンの放出、さらには生殖細胞の発達を制御し、重要な生理プロセスの実行者として機能しています。