为了证明对TOM/TIM前导序列导入途径的功能依赖(例如,Δψm依赖性、TIM23/TOM20需求)尚未直接证实:
选项1
实施TOMM20和TIMM23的慢病毒shRNA敲低(使用PLKO.在Huh7或HEK293T细胞中进行,通过Western blot验证,然后通过(i)线粒体分级分离并使用细胞器标志物(COX IV、TOM40、GAPDH)和(ii)蛋白酶K保护实验来定量内源性Par3的导入。同时,通过在MTS-EGFP或FL-Par3-EGFP转染细胞中使用FCCP(1–2 μM,30–60分钟)处理,随后进行成像或分级分离,使用COX IV免疫荧光作为Δψm非依赖性的线粒体标记物,测试Δψm依赖性。这将提供因果证据,证明TOM/TIM和Δψm是Par3导入所必需的。
选项2
建立一种体外导入实验,使用分离的线粒体(Beyotime试剂盒)和体外翻译的放射性标记Par3(或MTS-Par3)前体蛋白。测试导入在有无Δψm(FCCP)、有无蛋白酶以及有无重组TOM/TIM抑制(例如,抗体阻断)条件下的情况,并通过大小变化映射MPP加工。这将通过生化精度建立途径必要性和Δψm依赖性。