miRNAs在纤维化疾病中的调控机制及治疗应用研究综述

2025-08-29 MedSci xAi 发表于广东省
本文系统综述miRNAs在肝/心/肾纤维化中的调控机制,基于2023-2025年Stem Cell Res Ther等顶刊文献,详解外泌体递送miR-145-5p等治疗策略,包含TGF-β/Smad信号通路靶向、CRISPR-Cas9基因编辑等关键技术突破。

文献综述与研究方向设计

引言

微小核糖核酸(microRNAs, miRNAs)是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA分子,能够通过与靶标mRNA结合来抑制其翻译或促进其降解,从而在多种生物学过程中发挥调控作用。近年来,越来越多的研究表明,miRNAs在纤维化疾病中扮演着重要角色,特别是在成纤维细胞的激活和纤维化过程中。本文将围绕“miRNAs通过靶向B基因调节TGF-β诱导的xxx疾病中的成纤维细胞活化和纤维化”这一主题,进行文献综述和研究方向设计。

关键文献搜集

  1. Chen et al. (2025)

    • 文章标题: Melatonin-pretreated mesenchymal stem cell-derived exosomes alleviate cavernous fibrosis in a rat model of nerve injury-induced erectile dysfunction via miR-145-5p/TGF-β/Smad axis
    • 期刊名称: Stem Cell Res Ther
    • 发表年份: 2025
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1186/s13287-025-04173-0
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40001250/
  2. Liu et al. (2025)

    • 文章标题: Liver macrophage-derived exosomal miRNA-342-3p promotes liver fibrosis by inhibiting HPCAL1 in stellate cells
    • 期刊名称: Hum Genomics
    • 发表年份: 2025
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1186/s40246-025-00722-z
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39910671/
  3. Wang et al. (2023)

    • 文章标题: mmu-miRNA-342-3p promotes hepatic stellate cell activation and hepatic fibrosis induced by Echinococcus multilocularis infection via targeting Zbtb7a
    • 期刊名称: PLoS Negl Trop Dis
    • 发表年份: 2023
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1371/journal.pntd.0011520
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37490505/
  4. Zhang et al. (2023)

    • 文章标题: Construction and integrated analysis of the ceRNA network hsa_circ_0000672/miR-516a-5p/TRAF6 and its potential function in atrial fibrillation
    • 期刊名称: Sci Rep
    • 发表年份: 2023
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1038/s41598-023-34851-z
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37169841/
  5. Li et al. (2023)

    • 文章标题: Identification of biomarkers and prediction of upstream miRNAs in diabetic nephropathy
    • 期刊名称: Front Endocrinol (Lausanne)
    • 发表年份: 2023
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.3389/fendo.2023.1144331
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36896170/
  6. Xu et al. (2023)

    • 文章标题: Hsa_circ_0072765 knockdown inhibits proliferation, activation and migration in transforming growth factor-beta (TGF-β)-induced hepatic stellate cells (HSCs) by the miR-197-3p/TRPV3 axis
    • 期刊名称: Histol Histopathol
    • 发表年份: 2023
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.14670/HH-18-586
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36714978/
  7. Zhao et al. (2022)

    • 文章标题: Regulation of SMAD Signaling Pathway by miRNAs Associated with Myocardial Fibrosis: In silico Analysis of Target Gene Networks
    • 期刊名称: Biochemistry (Mosc)
    • 发表年份: 2022
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1134/S0006297922080144
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36171647/
  8. Chen et al. (2022)

    • 文章标题: MicroRNA global profiling in cystic fibrosis cell lines reveals dysregulated pathways related with inflammation, cancer, growth, glucose and lipid metabolism, and fertility: an exploratory study
    • 期刊名称: Acta Biomed
    • 发表年份: 2022
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.23750/abm.v93i3.12842
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35775757/
  9. Wang et al. (2023)

    • 文章标题: MircroRNA-145 Attenuates Cardiac Fibrosis Via Regulating Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 3
    • 期刊名称: Cardiovasc Drugs Ther
    • 发表年份: 2023
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1007/s10557-021-07312-w
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35416554/
  10. Li et al. (2022)

    • 文章标题: LongShengZhi alleviated cardiac remodeling via upregulation microRNA-150-5p with matrix metalloproteinase 14 as the target
    • 期刊名称: J Ethnopharmacol
    • 发表年份: 2022
    • DOI/PubMed ID: doi: 10.1016/j.jep.2022.115156
    • 原文地址: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35245628/

研究趋势分析

  1. 主要研究热点

    • miRNAs在纤维化中的作用:多篇文献探讨了miRNAs在不同器官(如心脏、肝脏、肺等)的纤维化过程中的调控机制。
    • TGF-β信号通路:TGF-β信号通路是纤维化过程中的关键通路,许多研究集中在miRNAs如何通过调节TGF-β信号通路来影响纤维化。
    • 外泌体介导的miRNA传递:外泌体作为一种有效的miRNA传递载体,被广泛研究用于治疗纤维化疾病。
  2. 技术趋势

    • 高通量测序技术:高通量测序技术(如RNA-seq)被广泛应用于miRNAs的表达谱分析,有助于发现新的miRNA及其靶基因。
    • 生物信息学分析:生物信息学工具(如KEGG、STRING等)用于预测miRNA的靶基因和信号通路,提高了研究的效率和准确性。
    • CRISPR-Cas9技术:CRISPR-Cas9技术被用于敲除或过表达特定的miRNA,以验证其功能。
  3. 方法学进展

    • 体内外实验结合:大多数研究采用了体内外实验相结合的方法,通过动物模型和细胞实验验证miRNAs的功能。
    • 多组学联合分析:多组学(如转录组、蛋白质组、代谢组等)联合分析提供了更全面的视角,有助于揭示复杂的调控网络。
  4. 存在的争议或不足

    • miRNA的特异性:miRNAs通常可以靶向多个基因,因此其特异性较低,可能导致研究结果的不一致。
    • 外泌体的分离纯化:外泌体的分离纯化技术尚未完全标准化,不同的分离方法可能会影响实验结果。
    • 临床转化:尽管实验室研究取得了许多进展,但将这些成果转化为临床应用仍面临许多挑战,如miRNA的递送效率和安全性问题。

理论框架梳理

  1. TGF-β信号通路:TGF-β信号通路在纤维化过程中起着核心作用,通过激活SMAD蛋白家族,调控下游基因的表达,促进成纤维细胞的活化和纤维化。
  2. miRNA调控网络:miRNAs通过与靶标mRNA结合,抑制其翻译或促进其降解,从而在多个层面上调控基因表达。许多研究揭示了miRNAs与TGF-β信号通路之间的相互作用。
  3. 外泌体介导的细胞间通讯:外泌体作为一种细胞间通讯的重要方式,可以携带miRNAs等生物活性分子,介导细胞间的信号传递,参与纤维化过程的调控。

方法论评述

  1. 定性研究方法

    • 文献综述:通过对已有文献的综合分析,总结miRNAs在纤维化中的作用机制。
    • 案例研究:通过分析特定病例,探讨miRNAs在个体化治疗中的应用潜力。
  2. 定量研究方法

    • 高通量测序:通过RNA-seq等技术,全面分析miRNAs的表达谱。
    • qPCR和Western Blot:用于验证特定miRNA及其靶基因的表达水平。
    • 细胞实验:通过细胞培养和转染实验,验证miRNAs的功能。
    • 动物模型:通过建立动物模型,评估miRNAs在体内条件下的作用。

主要发现总结

  1. miR-145-5p通过抑制TGF-β/Smad轴,减轻阴茎海绵体纤维化(Chen et al., 2025)。
  2. 肝巨噬细胞来源的外泌体miR-342-3p通过抑制HPCAL1,促进肝星状细胞活化和肝纤维化(Liu et al., 2025)。
  3. mmu-miR-342-3p通过靶向Zbtb7a,促进Echinococcus multilocularis感染引起的肝纤维化(Wang et al., 2023)。
  4. hsa_circ_0000672通过海绵miR-516a-5p,间接调节TRAF6的表达,参与心房颤动相关的心房纤维化(Zhang et al., 2023)。
  5. MMP2作为糖尿病肾病的生物标志物,其表达受miR-106b-5p和miR-93-5p的调控(Li et al., 2023)。

争议和辩论

  1. miRNA的特异性问题:一些研究认为miRNAs具有较高的特异性,而另一些研究则指出miRNAs可能靶向多个基因,导致功能不明确。
  2. 外泌体的分离纯化方法:不同的外泌体分离方法可能影响实验结果的一致性,目前尚无统一的标准。
  3. miRNA的递送效率和安全性:虽然外泌体是一种有前景的miRNA递送载体,但其递送效率和安全性仍需进一步研究。

研究限制

  1. 样本量有限:许多研究的样本量较小,难以得出普遍适用的结论。
  2. 实验设计的局限性:部分研究仅限于体外实验,缺乏体内验证。
  3. 生物信息学分析的可靠性:生物信息学工具的预测结果需要实验验证,存在一定的不确定性。

未来研究方向

  1. 研究方向一:miR-145-5p在不同器官纤维化中的作用

    • 研究题目: 探讨miR-145-5p在肺纤维化中的作用及其机制
    • 研究价值: 肺纤维化是一种严重的慢性疾病,目前缺乏有效的治疗方法。研究miR-145-5p在肺纤维化中的作用,有助于开发新的治疗策略。
    • 方法: 通过RNA-seq分析miR-145-5p在肺纤维化患者中的表达谱,结合体内外实验验证其功能。
    • 预期创新点: 揭示miR-145-5p在肺纤维化中的新机制,为临床治疗提供理论支持。
    • 潜在影响: 为肺纤维化的诊断和治疗提供新的靶点。
  2. 研究方向二:外泌体介导的miRNA传递在纤维化治疗中的应用

    • 研究题目: 优化外泌体介导的miRNA传递方法,提高其在肝纤维化治疗中的效果
    • 研究价值: 外泌体作为一种天然的纳米载体,具有良好的生物相容性和低免疫原性,是理想的miRNA递送载体。优化其传递方法,有助于提高治疗效果。
    • 方法: 通过比较不同外泌体分离纯化方法的效果,选择最优方案。结合CRISPR-Cas9技术,构建稳定表达miR-145-5p的外泌体,进行体内外实验验证。
    • 预期创新点: 开发高效的外泌体介导的miRNA传递方法,提高其在肝纤维化治疗中的应用价值。
    • 潜在影响: 为肝纤维化的治疗提供新的技术手段。
  3. 研究方向三:多组学联合分析在纤维化研究中的应用

    • 研究题目: 利用多组学联合分析,揭示miR-145-5p在心肌纤维化中的调控网络
    • 研究价值: 心肌纤维化是心脏病发展的重要阶段,多组学联合分析有助于全面理解其复杂的调控机制。
    • 方法: 通过转录组、蛋白质组和代谢组联合分析,构建miR-145-5p在心肌纤维化中的调控网络。结合体内外实验验证关键节点的功能。
    • 预期创新点: 揭示miR-145-5p在心肌纤维化中的新调控机制,为治疗提供新的靶点。
    • 潜在影响: 为心肌纤维化的诊断和治疗提供新的思路和技术手段。
  4. 研究方向四:miRNA在纤维化中的个体化治疗

    • 研究题目: 基于miRNA表达谱的个体化治疗策略在糖尿病肾病中的应用
    • 研究价值: 糖尿病肾病是一种常见的并发症,个体化治疗策略有助于提高治疗效果。
    • 方法: 通过分析糖尿病肾病患者的miRNA表达谱,筛选出关键miRNA。结合临床数据,评估这些miRNA在个体化治疗中的应用潜力。
    • 预期创新点: 提出基于miRNA表达谱的个体化治疗策略,提高糖尿病肾病的治疗效果。
    • 潜在影响: 为糖尿病肾病的个体化治疗提供新的方法和思路。
  5. 研究方向五:miRNA在纤维化中的长期效应研究

    • 研究题目: 长期观察miR-145-5p在肝纤维化中的动态变化及其对疾病进展的影响
    • 研究价值: 长期效应研究有助于理解miRNA在纤维化过程中的动态变化,为疾病的早期诊断和干预提供依据。
    • 方法: 通过长期随访肝纤维化患者,定期检测miR-145-5p的表达水平,结合临床数据,评估其对疾病进展的影响。
    • 预期创新点: 揭示miR-145-5p在肝纤维化中的长期动态变化规律,为疾病的早期诊断和干预提供新的指标。
    • 潜在影响: 为肝纤维化的早期诊断和干预提供新的方法和思路。

结论

miRNAs在纤维化疾病中发挥着重要的调控作用,特别是通过靶向TGF-β信号通路,调控成纤维细胞的活化和纤维化过程。尽管已有许多研究取得了重要进展,但仍存在一些争议和不足,需要进一步的研究来解决。未来的研究方向应集中在miRNAs在不同器官纤维化中的作用、外泌体介导的miRNA传递、多组学联合分析、个体化治疗以及长期效应研究等方面,以期为纤维化疾病的诊断和治疗提供新的思路和技术手段。

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